Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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