Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01652 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01652 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01652 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01652 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01652 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01652 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01652 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01652 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms