Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt5hO55201 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms