Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms