Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edil3O35474 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms