Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Casq1O09165 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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