Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp558E9Q1J0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp558E9Q1J0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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