Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms