Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrklB2RRL2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JrklB2RRL2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms