Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020011L13RikA0A087WQI7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms