Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rlbp1Q9Z275 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rlbp1Q9Z275 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rlbp1Q9Z275 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rlbp1Q9Z275 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rlbp1Q9Z275 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.3 ms