Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn6Q9Z262 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn6Q9Z262 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn6Q9Z262 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms