Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thbs4Q9Z1T2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs4Q9Z1T2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs4Q9Z1T2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs4Q9Z1T2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms