Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx39bQ9Z1N5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms