Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vsig2Q9Z109 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsig2Q9Z109 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig2Q9Z109 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms