Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip2Q9Z0H8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip2Q9Z0H8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip2Q9Z0H8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip2Q9Z0H8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Clip2Q9Z0H8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip2Q9Z0H8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip2Q9Z0H8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms