Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ap4s1Q9WVL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ap4s1Q9WVL1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ap4s1Q9WVL1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ap4s1Q9WVL1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ap4s1Q9WVL1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21,98■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ap4s1Q9WVL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Ap4s1Q9WVL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Ap4s1Q9WVL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ap4s1Q9WVL1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms