Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cyp46a1Q9WVK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cyp46a1Q9WVK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Cyp46a1Q9WVK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Cyp46a1Q9WVK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Cyp46a1Q9WVK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,7 ms