Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carm1Q9WVG6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carm1Q9WVG6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Carm1Q9WVG6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms