Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme3Q9WV85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme3Q9WV85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme3Q9WV85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nme3Q9WV85 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms