Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec2Q9WV35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apobec2Q9WV35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apobec2Q9WV35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec2Q9WV35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms