Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd7Q9WTY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd7Q9WTY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd7Q9WTY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms