Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp18Q9WTV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp18Q9WTV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp18Q9WTV6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp18Q9WTV6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms