Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn8aQ9WTU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn8aQ9WTU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn8aQ9WTU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn8aQ9WTU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms