Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sorbs3Q9R1Z8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sorbs3Q9R1Z8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sorbs3Q9R1Z8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms