Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb2Q9R1P3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb2Q9R1P3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349 ms