Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf7Q9R1C0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf7Q9R1C0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Taf7Q9R1C0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf7Q9R1C0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Taf7Q9R1C0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms