Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf346Q9R0B7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf346Q9R0B7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf346Q9R0B7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf346Q9R0B7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms