Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ripk3Q9QZL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ripk3Q9QZL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ripk3Q9QZL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ripk3Q9QZL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms