Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc4Q9QZD4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc4Q9QZD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc4Q9QZD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc4Q9QZD4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms