Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo1Q9QZ11 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Exo1Q9QZ11 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo1Q9QZ11 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Exo1Q9QZ11 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms