Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd4Q9QY39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd4Q9QY39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzd4Q9QY39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms