Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp3Q9QY23 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp3Q9QY23 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp3Q9QY23 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms