Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Foxe3Q9QY14 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxe3Q9QY14 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxe3Q9QY14 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxe3Q9QY14 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxe3Q9QY14 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxe3Q9QY14 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms