Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx8Q9QXV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx8Q9QXV1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms