Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip4Q9QXN3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip4Q9QXN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip4Q9QXN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip4Q9QXN3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip4Q9QXN3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip4Q9QXN3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip4Q9QXN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip4Q9QXN3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms