Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a1Q9QX15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3a1Q9QX15 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a1Q9QX15 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3a1Q9QX15 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms