Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyth1Q9QX11 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyth1Q9QX11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyth1Q9QX11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth1Q9QX11 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth1Q9QX11 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms