Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arl6ip4Q9JM93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arl6ip4Q9JM93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arl6ip4Q9JM93 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arl6ip4Q9JM93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl6ip4Q9JM93 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arl6ip4Q9JM93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl6ip4Q9JM93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arl6ip4Q9JM93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl6ip4Q9JM93 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms