Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrfQ9JM73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SrfQ9JM73 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrfQ9JM73 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrfQ9JM73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrfQ9JM73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms