Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgm1Q9JLF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgm1Q9JLF6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgm1Q9JLF6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms