Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace2Q9JL18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace2Q9JL18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace2Q9JL18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace2Q9JL18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace2Q9JL18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms