Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Upk3aQ9JKX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Upk3aQ9JKX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upk3aQ9JKX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms