Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip1Q9JKW0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms