Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trem1Q9JKE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trem1Q9JKE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trem1Q9JKE2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms