Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ybx3Q9JKB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ybx3Q9JKB3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ybx3Q9JKB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Ybx3Q9JKB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ybx3Q9JKB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ybx3Q9JKB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ybx3Q9JKB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms