Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard6bQ9JK83 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard6bQ9JK83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard6bQ9JK83 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms