Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scube2Q9JJS0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scube2Q9JJS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scube2Q9JJS0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scube2Q9JJS0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scube2Q9JJS0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scube2Q9JJS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms