Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Efcc1Q9JJF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efcc1Q9JJF6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Efcc1Q9JJF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Efcc1Q9JJF6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms