Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rilpl1Q9JJC6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rilpl1Q9JJC6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rilpl1Q9JJC6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rilpl1Q9JJC6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rilpl1Q9JJC6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms